2002年5月30日，科技部、农业部、水利部、国家林业局、中国科学院、中国农业银行等六部委批复启动海南儋州国家农业科技园区(试点)建设(国科发农社字[2002] 163号)。

2009年11月，华南热带农业大学与海南大学合并之后，海南省人民政府与农业部签订了《海南省人民政府、农业部推进海南儋州国家农业科技园区管理和发展的意见(备忘录)》，明确园区在“以省为主，省部共建，创新机制，共同推进”的管理模式下运行，充分发挥中国热带农业科学院的科研优势、人才优势和成果优势，大力推动热带农业科技成果转化和示范推广，促进产学研一体化，把园区建成为立足海南、辐射热区的热带农业科技成果转化、示范推广、培训服务的窗口和支持地方发展现代农业的重要载体。

2010年1月，园区正式通过科技部评估验收，成为海南省当时唯 一的国 家级农业科技园区。2013年3月，园区再次通过了科技部评估验收。在科技部《国家农业科技园区创新能力评价报告2015》中，儋州园区的创新能力指数在106个国家农业科技园区中居前10位，属于创新引领类园区。

当前，园区按照国家创新驱动发展战略、乡村振兴战略及国家农业科技园区发展规划(2018-2025年)等战略部署，积极响应海南国际旅游岛和自由贸易试验区建设，充分发挥海南省和农业农村部共建园区的优势，加强热带农业科技研发、技术成果试验示范和推广应用，加强新型职业农民培训、农业高新技术产业培育，立足海南，面向全国热区，辐射世 界热区，服务国家乡村振兴战略，服务国家“一带一路”倡议，服务国家农业科技外交，不断取得良好的经济效益、社会效益和生态效益。

“十三五”内，国家热带农业科技博览园和农业农村部热带农业对外开放合作试验区将在园区核心区内建成，核心区将成为科研、生产、教育、科普、生态、旅游、休闲、宜居等多产融合的开放、和谐、美丽的特色小镇。

园区规划总面积52万亩，其中核心区2万亩，在儋州市宝岛新村，规划有科技创新、展示示范、产业化三大类13个功能区。示范区10万亩，辐射区40万亩，规划在海南全省多点分布。随着园区建设与发展，示范面积和辐射区域将不断扩大。

截至目前，核心区建成多功能培训办公大楼12500多㎡、试验与中试工厂面积10000多㎡、设施大棚20000多㎡，建成连接核心区与儋州市区的科技大道5.85公里。建成示范区示范基地10个，面积10.24万亩，辐射区示范基地50个，面积90.3万亩。其中示范区分布在儋州、海口、白沙、乐东、陵水、澄迈、定安、琼中等市县，辐射区分布在全省各地。部分示范基地分布在云南、四川、广东、广西等省区。园区现有200多名科技特派员为示范区和辐射区农民、农企服务，派出科技特派员50多人前往国外热区实施对外技术援助与培训项目，热带农业科技成果辐射到了越南、缅甸、柬埔寨、老挝、泰国、刚果(布)、尼日利亚、莫桑比克等国家。

目前，园区拥有可可系列、咖啡系列、胡椒系列、香水系列、木薯系列、椰子系列、辣木系列、茶树精油系列、沉香系列、艾纳香系列，以及橡胶生产专用肥、割面保护剂、电动胶刀、酸性土壤改良肥等等科技开发产品200多个。